會議同意，對金育輝（吉林省副省長，2017年4月起分管吉林省食品藥品監管工作）予以免職；
對李晉修（吉林省政協副主席，2015年12月-2017年4月任分管吉林省食品藥品監管工作的副省長）責令辭職；
要求劉長龍（長春市市長，2016年9月任長春市代市長，2016年10月至今任長春市市長）引咎辭職；
畢井泉（市場監管總局黨組書記、副局長，2015年2月-2018年3月任原食品藥品監管總局局長）引咎辭職；
要求姜治瑩（吉林省委常委、延邊朝鮮族自治州委書記，2012年3月-2016年5月任長春市委副書記、市長）、焦紅（國家藥監局局長）作出深刻檢查；
對35名非中管干部進行問責。
決定中央紀委國家監委對吳湞（原食品藥品監管總局副局長、原衛生計生委副主任，分管藥化注冊管理、藥化監管和審核檢驗等工作）進行立案審查調查。
會議責成吉林省委和省政府、國家藥監局向中共中央、國務院作出深刻檢查。
會議指出，這起問題疫苗案件發生以來，習近平總書記高度重視，多次作出重要指示，要求立即查清事實真相，嚴肅問責，依法從嚴處理，堅決守住安全底線，全力保障群眾切身利益和社會穩定大局。在黨中央堅強領導下，國務院多次召開會議研究，派出調查組進行調查，目前已基本查清案件情況和有關部門及干部履行職責情況。
會議強調，疫苗關系人民群眾健康，關系公共衛生安全和國家安全。這起問題疫苗案件是一起疫苗生產者逐利枉法、違反國家藥品標準和藥品生產質量管理規范、編造虛假生產檢驗記錄、地方政府和監管部門失職失察、個別工作人員瀆職的嚴重違規違法生產疫苗的重大案件，情節嚴重，性質惡劣，造成嚴重不良影響，既暴露出監管不到位等諸多漏洞，也反映出疫苗生產流通使用等方面存在的制度缺陷。要深刻汲取教訓，舉一反三，重典治亂，去疴除弊，加快完善疫苗藥品監管長效機制，堅決守住公共安全底線，堅決維護最廣大人民身體健康。
會議強調，要完善法律法規和制度規則，明晰和落實監管責任，加強生產過程現場檢查，督促企業履行主體責任義務，建立質量安全追溯體系，落實產品風險報告制度。對風險高、專業性強的疫苗藥品，要明確監管事權，在地方屬地管理的基礎上，要派出機構進行檢查。要加強監管隊伍能力建設，盡快建立健全疫苗藥品的職業化、專業化檢查隊伍。要提高違法成本，對那些利欲熏心、無視規則的不法企業，對那些敢于挑戰道德和良知底線的人，要嚴厲打擊，從嚴重判，決不姑息。對涉及疫苗藥品等危害公共安全的違法犯罪人員，要依法嚴厲處罰，實行巨額處罰、終身禁業。要加強干部隊伍建設，激勵擔當作為，切實履行職責，對失職瀆職行為嚴肅問責。
